Phát huy ưu thế trong lĩnh vực xây dựng công trình hàng hải, công trình cảng đường thủy, Tổng công ty đã giao Công ty CP Xây dựng công trình hàng hải miền Nam thực hiện thi công xây dựng các trạm quản lý, các trạm đèn biển như trạm đèn Trường Sa Lớn, đèn biển Sinh Tồn thuộc khu vực quần đảo Trường Sa, thi công xây dựng tuyến luồng Đồng Nai…. Đồng thời, Tổng công ty cũng đã thực hiện một số công trình như cải tạo kè và khu neo đậu cảng Rạch Bà; thi công đóng kè Mũi Đèn Đỏ… Các công trình này có điều kiện thi công không thuận lợi, thường ở nơi xa xôi, biệt lập, có địa hình phức tạp và thời tiết hết sức khắc nghiệt hoặc ở trên sông, cửa sông, cửa biển nên chịu ảnh hưởng bởi sóng gió, thủy triều, dòng chảy… nhưng với đội ngũ kỹ sư giỏi chuyên môn, giàu kinh nghiệm và yêu nghề, chất lượng công trình và an toàn lao động luôn được đảm bảo.
Hải đăng Trường Sa Lớn – quần đảo Trường Sa được thi công năm 2009
Hải đăng Sinh Tồn – quần đảo Trường Sa được thi công năm 2010
